Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms