Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTIF3Q9H2K0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTIF3Q9H2K0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms