Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCL11BQ9C0K0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL11BQ9C0K0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms