Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms