Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT23Q9C075 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms