Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM8Q9BZR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms