Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms