Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms