Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC94Q9BW85 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms