Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC2P3Q9BVR0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms