Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTA3Q9BTC8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms