Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms