Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMSS1Q9BQ75 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms