Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MYD88Q99836 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms