Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms