Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALS2Q96Q42 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms