Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms