Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP53Q96M91 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms