Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms