Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF4Q96M43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF4Q96M43 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF4Q96M43 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF4Q96M43 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF4Q96M43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms