Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LRRIQ1Q96JM4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRIQ1Q96JM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRIQ1Q96JM4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
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