Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms