Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms