Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms