Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROPN1LQ96C74 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROPN1LQ96C74 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms