Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPSB1Q96BD6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms