Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRF1Q92994 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRF1Q92994 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms