Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SSMEM1Q8WWF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSMEM1Q8WWF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms