Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRIM41Q8WV44 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms