Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms