Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms