Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PROM2Q8N271 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PROM2Q8N271 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PROM2Q8N271 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms