Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOT1Q8IXI2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms