Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms