Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD1L3Q7Z443 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms