Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms