Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCTD18Q6PI47 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCTD18Q6PI47 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms