Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC144NLQ6NUI1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC144NLQ6NUI1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms