Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC70Q6NSX1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms