Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF6Q6KF10 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF6Q6KF10 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms