Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCSD1Q6JBY9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms