Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf57Q5W0N0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms