Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEP78Q5JTW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms