Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms