Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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