Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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