Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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