Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms