Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS72Q15906 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms