Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN9AQ15858 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN9AQ15858 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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